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2022年 单细胞基因组学 数据预处理 进阶 (Intermediate)

alevin-fry

基于轻量级比对的内存高效单细胞定量工具,通过简化伪比对和轻量级分辨算法大幅降低内存需求。 该方法在保持定量准确性的同时将内存占用降至传统方法的十分之一,适合在普通计算环境下处理大规模单细胞数据集。
:material-target: 用途
内存高效的单细胞 RNA-seq 定量
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * k)
:material-memory: 空间复杂度
O(g)
:material-code: 实现语言
Rust

相关工具

Alevin · kallisto-bustools · STARsolo

标签

[quantification](tags.md#quantification) [memory-efficient](tags.md#memory-efficient) [simpleaf](tags.md#simpleaf) [frugal](tags.md#frugal)

:material-folder: 分类:单细胞基因组学 / 数据预处理 | :material-identifier: ID:alevin-fry