AUGUSTUS¶
2005年 基因预测 真核基因预测 进阶 (Intermediate)
AUGUSTUS
基于广义隐马尔可夫模型的真核基因从头预测工具，能准确预测基因结构包括外显子、内含子、UTR 和剪接位点。 该方法支持整合 RNA-seq 和同源蛋白等外部证据作为提示信息，显著提高新基因组注释的预测准确性。
:material-target: 用途
真核生物基因结构从头预测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * s^2):material-memory: 空间复杂度
O(n * s):material-code: 实现语言
C++
相关工具¶
GeneMark · SNAP · BRAKER
标签¶
[gene-prediction](tags.md#gene-prediction) [eukaryotic](tags.md#eukaryotic) [hmm](tags.md#hmm) [ab-initio](tags.md#ab-initio)