AUGUSTUS¶
2003年 基因预测 真核基因预测
AUGUSTUS
基于广义隐马尔可夫模型的真核基因预测工具，能准确预测基因结构包括外显子、内含子和 UTR。 该方法支持使用 RNA-seq 和蛋白质同源性作为外部提示信息，显著提高预测准确性。
:material-target: 用途
真核生物基因结构从头预测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * s^2):material-memory: 空间复杂度
O(n * s)相关工具¶
GeneMark · SNAP · GlimmerHMM
标签¶
[ghmm](tags.md#ghmm) [ab-initio](tags.md#ab-initio) [exon-intron](tags.md#exon-intron) [rna-seq-hints](tags.md#rna-seq-hints)