Ballgown¶
2014年 基因表达分析 差异表达 进阶 (Intermediate)
Ballgown
基于 FPKM 值的转录本差异表达分析工具,使用线性模型和统计检验检测条件间 的表达差异。该方法与 StringTie 流程紧密集成,提供转录本和外显子水平的 差异分析功能。
:material-target: 用途
基于 FPKM 的转录本差异表达分析
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * g):material-memory: 空间复杂度
O(g):material-code: 实现语言
R
相关工具¶
DESeq2 · StringTie · Cufflinks
标签¶
[differential-expression](tags.md#differential-expression) [fpkm](tags.md#fpkm) [transcript-level](tags.md#transcript-level) [linear-model](tags.md#linear-model)