Bismark¶
2011年 表观基因组学 甲基化分析 进阶 (Intermediate)
Bismark
亚硫酸氢盐测序数据的比对和甲基化分析工具，通过 C-to-T 转换双链比对策略处理亚硫酸氢盐转化后的序列。 该方法能同时鉴定 CpG、CHG 和 CHH 位点的甲基化状态，并提供详细的甲基化水平定量报告。
:material-target: 用途
亚硫酸氢盐测序数据的比对和甲基化定量
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * g):material-memory: 空间复杂度
O(g):material-code: 实现语言
Perl
相关工具¶
BSseeker2 · methylKit · bwa-meth
标签¶
[bisulfite](tags.md#bisulfite) [methylation](tags.md#methylation) [alignment](tags.md#alignment) [epigenetics](tags.md#epigenetics)