Bismark¶
2011年 表观基因组学 甲基化分析
Bismark
亚硫酸氢盐测序数据的比对和甲基化分析工具,处理 C-to-T 转换后的序列比对和甲基化水平量化。 该方法能区分 CpG、CHG、CHH 不同类型的甲基化,是 DNA 甲基化分析的核心工具。
:material-target: 用途
亚硫酸氢盐测序数据的比对和甲基化定量
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * g):material-memory: 空间复杂度
O(g)相关工具¶
BSseeker2 · methylKit · bwa-meth
标签¶
[bisulfite-seq](tags.md#bisulfite-seq) [methylation](tags.md#methylation) [cpg](tags.md#cpg) [epigenetic](tags.md#epigenetic)