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Bismark

2011年 表观基因组学 甲基化分析

Bismark

亚硫酸氢盐测序数据的比对和甲基化分析工具,处理 C-to-T 转换后的序列比对和甲基化水平量化。 该方法能区分 CpG、CHG、CHH 不同类型的甲基化,是 DNA 甲基化分析的核心工具。
:material-target: 用途
亚硫酸氢盐测序数据的比对和甲基化定量
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * g)
:material-memory: 空间复杂度
O(g)

相关工具

BSseeker2 · methylKit · bwa-meth

标签

[bisulfite-seq](tags.md#bisulfite-seq) [methylation](tags.md#methylation) [cpg](tags.md#cpg) [epigenetic](tags.md#epigenetic)

:material-folder: 分类:表观基因组学 / 甲基化分析 | :material-identifier: ID:bismark