Bowtie2¶
2012年 序列比对 双序列比对
Bowtie2
基于 FM 索引的超快速短读段比对工具，支持局部比对和端到端比对模式。 该方法使用全文本分钟索引实现亚线性时间比对，是短读段比对的标准工具之一。
:material-target: 用途
短读段快速比对到参考基因组
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(n)相关工具¶
BWA · HISAT2 · Minimap2
标签¶
[fm-index](tags.md#fm-index) [short-read](tags.md#short-read) [fast](tags.md#fast) [high-throughput](tags.md#high-throughput)