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Canu

2017年 序列组装 从头组装 高级 (Advanced)

Canu

针对单分子长读段设计的从头组装工具,通过纠错、修剪和组装三个阶段处理高噪声长读段数据。 该方法支持 PacBio 和 Oxford Nanopore 测序数据,能够产生高质量的连续组装序列。
:material-target: 用途
单分子长读段纠错与组装
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n^2)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)
:material-code: 实现语言
Java

相关工具

Flye · Hifiasm · Miniasm

标签

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