Canu¶
2017年 序列组装 从头组装 高级 (Advanced)
Canu
针对单分子长读段设计的从头组装工具,通过纠错、修剪和组装三个阶段处理高噪声长读段数据。 该方法支持 PacBio 和 Oxford Nanopore 测序数据,能够产生高质量的连续组装序列。
:material-target: 用途
单分子长读段纠错与组装
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n^2):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
Java
相关工具¶
Flye · Hifiasm · Miniasm
标签¶
[long-read](tags.md#long-read) [pacbio](tags.md#pacbio) [ont](tags.md#ont) [error-correction](tags.md#error-correction)