Cell Ranger¶
2017年 单细胞基因组学 数据预处理
Cell Ranger
10x Genomics 开发的单细胞 RNA-seq 数据处理流水线，完成从原始数据到基因表达矩阵的全流程分析。 该工具集成了比对、细胞条码识别、UMI 计数等步骤，是单细胞数据预处理的行业标准。
:material-target: 用途
单细胞 RNA-seq 数据预处理和定量
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * g):material-memory: 空间复杂度
O(c * g)相关工具¶
STARsolo · Alevin · Kallisto-bustools
标签¶
[10x-genomics](tags.md#10x-genomics) [preprocessing](tags.md#preprocessing) [umi](tags.md#umi) [pipeline](tags.md#pipeline)