CellChat¶
2021年 空间组学 空间蛋白质组学 进阶 (Intermediate)
CellChat
基于配体-受体相互作用数据库推断细胞间通讯的方法，可从单细胞或空间转录组 数据中识别显著的细胞通讯通路。该方法整合了信号通路信息，提供通讯网络的 可视化和功能推断。
:material-target: 用途
基于配体-受体互作的细胞通讯推断
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(c^2 * g):material-memory: 空间复杂度
O(c^2):material-code: 实现语言
R
相关工具¶
CellPhoneDB · NicheNet · squidpy
标签¶
[cell-communication](tags.md#cell-communication) [ligand-receptor](tags.md#ligand-receptor) [signaling](tags.md#signaling) [network](tags.md#network)