CellTypist¶
2022年 单细胞基因组学 细胞聚类与注释 进阶 (Intermediate)
CellTypist
基于逻辑回归模型的自动化细胞类型注释工具，使用大规模参考数据集快速推断未知单细胞样本的细胞类型。 该方法支持在线学习和多级注释，在免疫细胞分类等场景中具有较高的准确性和运行效率。
:material-target: 用途
基于逻辑回归的自动化细胞类型注释
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(c * g):material-memory: 空间复杂度
O(c * g):material-code: 实现语言
Python
相关工具¶
scANVI · scVI · Seurat
标签¶
[cell-type](tags.md#cell-type) [annotation](tags.md#annotation) [logistic-regression](tags.md#logistic-regression) [reference-based](tags.md#reference-based)