ChromHMM¶
2012年 表观基因组学 ChIP-seq 分析
ChromHMM
基于隐马尔可夫模型的染色质状态注释工具，整合多种组蛋白修饰信号自动学习和标注染色质状态。 该方法能发现启动子、增强子、异染色质等功能区域，是表观基因组注释的标准方法。
:material-target: 用途
染色质状态自动发现和基因组注释
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * s^2):material-memory: 空间复杂度
O(n * s)相关工具¶
Segway · ENCODE · EpiCSeg
标签¶
[hmm](tags.md#hmm) [chromatin-state](tags.md#chromatin-state) [histone](tags.md#histone) [annotation](tags.md#annotation)