Clair3¶
2022年 变异检测 单核苷酸变异
Clair3
面向长读段测序数据的生殖系小型变异检测工具，结合堆叠图像和全比对两阶段深度学习模型进行变异分类。 该方法对 Nanopore 和 PacBio 数据均有出色表现，具有极高的准确率和良好的计算效率。
:material-target: 用途
基于长读段数据进行高精度生殖系变异检测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * r):material-memory: 空间复杂度
O(r)相关工具¶
DeepVariant · PEPPER-Margin-DeepVariant · Medaka
标签¶
[long-read](tags.md#long-read) [nanopore](tags.md#nanopore) [pacbio](tags.md#pacbio) [germline](tags.md#germline)