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CRAM

2011年 数据压缩 专用压缩

CRAM

专为比对数据设计的参考序列压缩格式,通过存储与参考序列的差异实现高压缩比。 该方法可将 BAM 文件压缩至原大小的 40-60%,是大规模测序项目的首选存储格式。
:material-target: 用途
比对数据的高效压缩存储
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n)
:material-memory: 空间复杂度
O(r)

相关工具

samtools · htslib · cramtools

标签

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