CRAM¶
2011年 数据压缩 专用压缩
CRAM
专为比对数据设计的参考序列压缩格式,通过存储与参考序列的差异实现高压缩比。 该方法可将 BAM 文件压缩至原大小的 40-60%,是大规模测序项目的首选存储格式。
:material-target: 用途
比对数据的高效压缩存储
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(r)相关工具¶
samtools · htslib · cramtools
标签¶
[reference-based](tags.md#reference-based) [alignment](tags.md#alignment) [bam](tags.md#bam) [efficient](tags.md#efficient)