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DIAMOND

2015年 序列比对 双序列比对 进阶 (Intermediate)

DIAMOND

基于双索引策略的超快速蛋白质和核苷酸序列比对工具,比 BLAST 快数万倍。 该方法在保持高灵敏度的同时大幅提升搜索速度,适用于大规模宏基因组学和蛋白质组学分析。
:material-target: 用途
超快速蛋白质和核苷酸序列比对
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(mn)
:material-memory: 空间复杂度
O(m + n)
:material-code: 实现语言
C++

相关工具

BLAST · MMseqs2 · RAPSearch2

标签

[heuristic](tags.md#heuristic) [protein-alignment](tags.md#protein-alignment) [fast](tags.md#fast) [ultra-fast](tags.md#ultra-fast)

:material-folder: 分类:序列比对 / 双序列比对 | :material-identifier: ID:diamond