Edlib¶
2017年 序列比对 双序列比对 进阶 (Intermediate)
Edlib
基于 Myers 位并行算法的快速编辑距离计算工具,支持前缀、后缀和全长比对模式。该方法在计算编辑距离和比对方面速度极快,是序列相似度估计的高效选择。
:material-target: 用途
快速编辑距离和序列比对
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(mn / w):material-memory: 空间复杂度
O(m):material-code: 实现语言
C++
相关工具¶
parasail · SeqAn · Biopython
标签¶
[edit-distance](tags.md#edit-distance) [bit-parallel](tags.md#bit-parallel) [fast](tags.md#fast) [myers](tags.md#myers)