FastTree¶
2010年 系统发育分析 距离法
FastTree
面向大规模多序列比对的近似最大似然建树工具，通过启发式搜索快速生成大规模系统发育树。 该方法在处理上万条序列时速度明显快于传统方法，是高通量进化分析和微生物组研究中的常用选择。
:material-target: 用途
大规模序列集合的快速近似最大似然建树
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * s * log n):material-memory: 空间复杂度
O(n * s)相关工具¶
IQ-TREE · RAxML-NG · PhyML
标签¶
[tree-building](tags.md#tree-building) [approximate-likelihood](tags.md#approximate-likelihood) [scalable](tags.md#scalable) [fast](tags.md#fast)