Flye¶
2019年 序列组装 从头组装
Flye
基于重复图的长读段从头组装工具,使用 A-Bruijn 图处理长读段中的重复序列。 该方法对 ONT 和 PacBio CLR 读段效果出色,能快速组装完整的微生物和中大型基因组。
:material-target: 用途
长读段快速从头组装
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n):material-memory: 空间复杂度
O(n)相关工具¶
Canu · Hifiasm · Miniasm
标签¶
[repeat-graph](tags.md#repeat-graph) [long-read](tags.md#long-read) [ont](tags.md#ont) [fast](tags.md#fast)