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Flye

2019年 序列组装 从头组装

Flye

基于重复图的长读段从头组装工具,使用 A-Bruijn 图处理长读段中的重复序列。 该方法对 ONT 和 PacBio CLR 读段效果出色,能快速组装完整的微生物和中大型基因组。
:material-target: 用途
长读段快速从头组装
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)

相关工具

Canu · Hifiasm · Miniasm

标签

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