Foldseek¶
2023年 蛋白质结构预测 模板方法
Foldseek
超高速蛋白质结构搜索工具,通过将三维结构编码为一维的 3Di 字母序列实现比传统方法快数万倍的结构相似性搜索。 该工具支持对大型结构数据库进行快速检索,是蛋白质功能注释、同源发现和结构聚类的重要利器。
:material-target: 用途
超快速蛋白质三维结构相似性搜索
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(n)相关工具¶
TM-align · DALI · MMseqs2
标签¶
[structure-search](tags.md#structure-search) [fast](tags.md#fast) [3Di](tags.md#3Di) [structural-alignment](tags.md#structural-alignment)