GATK HaplotypeCaller¶
2010年 变异检测 单核苷酸变异
GATK HaplotypeCaller
基于局部重组装的变异检测算法，通过在活跃区域进行局部单倍型组装来发现变异。 该方法能够同时检测 SNP 和 Indel，是目前最广泛使用的变异检测工具之一。
:material-target: 用途
检测 SNP 和小型 Indel 变异
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * r):material-memory: 空间复杂度
O(r)相关工具¶
GATK · Picard · BWA
标签¶
[haplotype](tags.md#haplotype) [snp](tags.md#snp) [indel](tags.md#indel) [germline](tags.md#germline)