GeneMark-ES¶
2005年 基因预测 原核基因预测 进阶 (Intermediate)
GeneMark-ES
自监督的真核和原核基因组基因预测工具,通过迭代训练概率模型自动识别编码区和基因边界。 该方法覆盖原核、真核和宏基因组等多种场景,是基因预测领域应用最广泛的算法家族之一。
:material-target: 用途
基于概率模型的多物种基因预测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
C
相关工具¶
AUGUSTUS · Prodigal · Glimmer
标签¶
[gene-prediction](tags.md#gene-prediction) [hmm](tags.md#hmm) [prokaryotic](tags.md#prokaryotic) [self-training](tags.md#self-training)