Genrich¶
2019年 表观基因组学 ChIP-seq 分析 进阶 (Intermediate)
Genrich
快速的基因组富集检测工具，通过信号与对照样本的比较在 ChIP-seq 和 ATAC-seq 数据中识别显著富集区域。 该方法运行速度极快，支持多组生物学重复的合并分析，适用于大规模表观基因组学筛选项目。
:material-target: 用途
ChIP-seq 和 ATAC-seq 数据的快速富集检测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
C
相关工具¶
MACS2 · HMMRATAC · SICER
标签¶
[chip-seq](tags.md#chip-seq) [peak-calling](tags.md#peak-calling) [fast](tags.md#fast) [atac-seq](tags.md#atac-seq)