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Glimmer

1998年 基因预测 原核基因预测 进阶 (Intermediate)

Glimmer

基于插值马尔可夫模型的微生物基因发现工具,通过从训练序列中学习编码区统计特征高效识别开放阅读框。 该方法是原核基因预测领域的经典算法,在完整基因组和草图组装中都能提供可靠的基因边界和起始位点预测。
:material-target: 用途
原核基因组的开放阅读框和基因边界预测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)
:material-code: 实现语言
C

相关工具

Prodigal · GeneMark · FragGeneScan

标签

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