GLIMMER¶
1998年 基因预测 原核基因预测
GLIMMER
面向细菌和古菌基因组的编码区识别工具,使用插值马尔可夫模型高效发现开放阅读框和起始位点。 该方法是原核基因预测的经典方案之一,在完整基因组和草图组装中都具有良好的准确性和计算效率。
:material-target: 用途
原核基因组中的开放阅读框与基因边界预测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(n)相关工具¶
Prodigal · GeneMark · FragGeneScan
标签¶
[interpolated-markov-model](tags.md#interpolated-markov-model) [prokaryotic](tags.md#prokaryotic) [gene-finding](tags.md#gene-finding) [classic](tags.md#classic)