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GLIMMER

1998年 基因预测 原核基因预测

GLIMMER

面向细菌和古菌基因组的编码区识别工具,使用插值马尔可夫模型高效发现开放阅读框和起始位点。 该方法是原核基因预测的经典方案之一,在完整基因组和草图组装中都具有良好的准确性和计算效率。
:material-target: 用途
原核基因组中的开放阅读框与基因边界预测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)

相关工具

Prodigal · GeneMark · FragGeneScan

标签

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