GRIDSS¶
2017年 变异检测 结构变异
GRIDSS
基于断裂端组装的基因组重排识别算法,通过局部组装和 split-read 信号精确定位结构变异断点。 该方法具有极高的灵敏度和特异性,能够检测复杂结构变异事件,是结构变异检测领域的重要工具。
:material-target: 用途
基于断裂端组装检测基因组结构变异
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * c):material-memory: 空间复杂度
O(n)相关工具¶
Delly · Manta · LUMPY
标签¶
[structural-variant](tags.md#structural-variant) [breakend](tags.md#breakend) [assembly-based](tags.md#assembly-based)