Harmony¶
2019年 单细胞基因组学 细胞聚类与注释
Harmony
面向多批次单细胞数据的整合方法，在低维嵌入空间中迭代校正批次效应并保留生物学信号。 该方法能与 Seurat、Scanpy 等分析流程无缝结合，是跨样本和跨平台单细胞整合分析的常用工具。
:material-target: 用途
多批次单细胞数据的批次校正与整合
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(c * k):material-memory: 空间复杂度
O(c * k)相关工具¶
Seurat · Scanpy · scVI
标签¶
[batch-correction](tags.md#batch-correction) [integration](tags.md#integration) [embedding](tags.md#embedding) [single-cell](tags.md#single-cell)