Hifiasm¶
2021年 序列组装 从头组装
Hifiasm
专为 PacBio HiFi 长读段设计的单倍型感知组装工具,利用高精度长读段实现染色体级别的组装。 该方法能够区分父本和母本单倍型,是当前最先进的基因组从头组装工具之一。
:material-target: 用途
HiFi 长读段的高质量单倍型组装
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n):material-memory: 空间复杂度
O(n)相关工具¶
Canu · Flye · Verkko
标签¶
[hifi](tags.md#hifi) [haplotype-aware](tags.md#haplotype-aware) [long-read](tags.md#long-read) [chromosome-level](tags.md#chromosome-level)