HISAT2¶
2015年 序列比对 双序列比对
HISAT2
基于层次化 FM 索引的剪接感知比对工具，使用全局和局部索引相结合的策略进行 RNA-seq 比对。 该方法内存占用低、速度快，能准确处理剪接比对，适用于 RNA-seq 和基因组比对。
:material-target: 用途
低内存、高速的剪接感知比对
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(n)相关工具¶
STAR · TopHat2 · BWA
标签¶
[fm-index](tags.md#fm-index) [splice-aware](tags.md#splice-aware) [rna-seq](tags.md#rna-seq) [low-memory](tags.md#low-memory)