HMMER¶
2011年 功能注释 结构域方法
HMMER
基于隐马尔可夫模型的序列分析算法,使用概率模型检测远程同源序列和蛋白质结构域。 该方法比简单的序列比对更敏感,能够发现进化距离较远的同源关系。
:material-target: 用途
蛋白质结构域识别和远程同源检测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(mn):material-memory: 空间复杂度
O(m)相关工具¶
Pfam · InterProScan · SMART
标签¶
[hmm](tags.md#hmm) [domain-detection](tags.md#domain-detection) [remote-homology](tags.md#remote-homology) [probabilistic](tags.md#probabilistic)