HMMRATAC¶
2019年 表观基因组学 ChIP-seq 分析
HMMRATAC
专为 ATAC-seq 设计的开放染色质识别算法，使用隐马尔可夫模型整合不同片段长度信号进行峰值检测。 该方法能同时刻画核小体缺失区与周围核小体结构，在开放染色质分析中具有较高分辨率和稳健性。
:material-target: 用途
基于 ATAC-seq 信号识别开放染色质区域
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(n)相关工具¶
MACS2 · Genrich · ATACseqQC
标签¶
[atac-seq](tags.md#atac-seq) [hmm](tags.md#hmm) [peak-calling](tags.md#peak-calling) [open-chromatin](tags.md#open-chromatin)