HOMER¶
2010年 表观基因组学 ChIP-seq 分析 进阶 (Intermediate)
HOMER
综合性 ChIP-seq 数据分析平台，集成峰值检测、从头基序发现和已知基序富集分析等多种功能模块。 该方法在转录因子结合位点鉴定和基序分析方面表现突出，支持多种表观基因组学实验设计的下游解析。
:material-target: 用途
ChIP-seq 数据分析与转录因子基序发现
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * m):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
Perl、C++
相关工具¶
MACS2 · MEME · ChromHMM
标签¶
[motif-discovery](tags.md#motif-discovery) [chip-seq](tags.md#chip-seq) [transcription-factor](tags.md#transcription-factor) [de-novo](tags.md#de-novo)