HUMAnN 3¶
2018年 宏基因组学 功能分析 进阶 (Intermediate)
HUMAnN 3
宏基因组功能谱分析流水线，通过整合物种分类和泛基因组映射实现基因家族和代谢通路的定量分析。 该方法采用两阶段策略先进行物种丰度估计再进行功能注释，能同时提供群落和物种水平的功能组成信息。
:material-target: 用途
宏基因组功能谱和代谢通路的定量分析
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * d):material-memory: 空间复杂度
O(d):material-code: 实现语言
Python
相关工具¶
MetaPhlAn · KEGG · eggNOG-mapper
标签¶
[functional-profiling](tags.md#functional-profiling) [pathway](tags.md#pathway) [gene-families](tags.md#gene-families) [metabolic](tags.md#metabolic)