Kallisto¶
2016年 基因表达分析 表达定量
Kallisto
基于伪比对的转录本定量算法，使用 k-mer 索引实现超快速的表达量估计。 该方法无需完整比对即可准确估计转录本丰度，大幅提升了分析速度。
:material-target: 用途
快速转录本定量
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(t)相关工具¶
Salmon · RSEM · Sleuth
标签¶
[pseudoalignment](tags.md#pseudoalignment) [quantification](tags.md#quantification) [rna-seq](tags.md#rna-seq) [fast](tags.md#fast)