KofamKOALA¶
2020年 功能注释 同源性方法
KofamKOALA
基于 KEGG Ortholog 隐马尔可夫模型配置文件的功能注释方法,可为蛋白序列快速分配 KO 编号和代谢通路信息。 该工具在灵敏度与精确度之间取得平衡,适合微生物基因组和宏基因组数据的高通量功能注释。
:material-target: 用途
基于 KEGG Ortholog 模型进行蛋白功能与通路注释
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * m):material-memory: 空间复杂度
O(m)相关工具¶
eggNOG-mapper · InterProScan · HMMER
标签¶
[kegg](tags.md#kegg) [orthology](tags.md#orthology) [annotation](tags.md#annotation) [pathway-analysis](tags.md#pathway-analysis)