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Kraken2

2019年 宏基因组学 物种分类

Kraken2

基于 k-mer 精确匹配的超快速物种分类工具,使用紧凑哈希表在数分钟内完成宏基因组样本的物种鉴定。 该方法速度极快且准确性高,支持自定义参考数据库,是宏基因组物种分类的首选工具。
:material-target: 用途
基于 k-mer 的超快速宏基因组物种分类
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * k)
:material-memory: 空间复杂度
O(d)

相关工具

Bracken · Centrifuge · CLARK

标签

[k-mer](tags.md#k-mer) [classification](tags.md#classification) [fast](tags.md#fast) [taxonomic](tags.md#taxonomic)

:material-folder: 分类:宏基因组学 / 物种分类 | :material-identifier: ID:kraken2