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LASTZ

2004年 序列比对 双序列比对 进阶 (Intermediate)

LASTZ

专为全基因组比对设计的成对比对工具,能够高效处理大规模基因组间的比对任务。 该方法采用种子扩展策略和得分矩阵,在基因组进化分析和保守区域检测中广泛应用。
:material-target: 用途
成对全基因组比对
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n^2)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)
:material-code: 实现语言
C

相关工具

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标签

[genome-alignment](tags.md#genome-alignment) [whole-genome](tags.md#whole-genome) [classic](tags.md#classic)

:material-folder: 分类:序列比对 / 双序列比对 | :material-identifier: ID:lastz