MACS2¶
2008年 表观基因组学 ChIP-seq 分析
MACS2
ChIP-seq 峰值检测的标准工具,使用泊松分布模型识别蛋白质-DNA 结合位点和组蛋白修饰区域。 该方法能有效校正局部偏差和背景噪声,支持窄峰和宽峰检测模式。
:material-target: 用途
ChIP-seq 数据的峰值检测和富集分析
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n):material-memory: 空间复杂度
O(n)相关工具¶
HOMER · SICER · ENCODE
标签¶
[peak-calling](tags.md#peak-calling) [chip-seq](tags.md#chip-seq) [histone](tags.md#histone) [transcription-factor](tags.md#transcription-factor)