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MANGO

2018年 数据压缩 专用压缩 高级 (Advanced)

MANGO

基于上下文建模的参考基因组无关序列压缩方法,通过学习序列局部统计特征实现基因组数据的高效压缩。 该方法无需参考基因组即可达到优秀的压缩比,适用于新物种或参考基因组不可用的场景。
:material-target: 用途
无需参考基因组的基因组序列压缩
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)
:material-code: 实现语言
C++

相关工具

Genozip · CRAM · gzip

标签

[reference-free](tags.md#reference-free) [genome-compression](tags.md#genome-compression) [context-modeling](tags.md#context-modeling)

:material-folder: 分类:数据压缩 / 专用压缩 | :material-identifier: ID:mango