MaSuRCA¶
2013年 序列组装 从头组装 进阶 (Intermediate)
MaSuRCA
马里兰超级读段组装器,整合短读段和长读段数据进行混合组装,利用超级读段压缩降低计算复杂度。 该方法支持多种测序平台数据的混合组装,适用于各类基因组的从头组装项目。
:material-target: 用途
混合测序数据的超级读段组装
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n):material-memory: 空间复杂度
O(n):material-code: 实现语言
C++
相关工具¶
SPAdes · SOAPdenovo2 · AllPaths-LG
标签¶
[hybrid](tags.md#hybrid) [super-read](tags.md#super-read) [de-novo](tags.md#de-novo) [versatile](tags.md#versatile)