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MaSuRCA

2013年 序列组装 从头组装 进阶 (Intermediate)

MaSuRCA

马里兰超级读段组装器,整合短读段和长读段数据进行混合组装,利用超级读段压缩降低计算复杂度。 该方法支持多种测序平台数据的混合组装,适用于各类基因组的从头组装项目。
:material-target: 用途
混合测序数据的超级读段组装
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n log n)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)
:material-code: 实现语言
C++

相关工具

SPAdes · SOAPdenovo2 · AllPaths-LG

标签

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