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MaxBin 2

2016年 宏基因组学 功能分析

MaxBin 2

利用覆盖度和组成偏好信息的自动分箱方法,通过期望最大化算法从宏基因组组装序列中恢复单个微生物基因组。 该工具在低丰度菌群和复杂环境样本中表现稳健,是宏基因组 binning 与 MAG 构建中的经典方法之一。
:material-target: 用途
基于覆盖度与组成特征进行宏基因组自动分箱
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * c)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)

相关工具

MetaBAT 2 · CONCOCT · CheckM

标签

[binning](tags.md#binning) [expectation-maximization](tags.md#expectation-maximization) [mags](tags.md#mags) [metagenome](tags.md#metagenome)

:material-folder: 分类:宏基因组学 / 功能分析 | :material-identifier: ID:maxbin2