MetaPhlAn¶
2012年 宏基因组学 物种分类
MetaPhlAn
基于标记基因的宏基因组物种组成分析工具，使用物种特异性标记序列精确量化微生物丰度。 该方法无需组装即可获得准确的物种丰度信息，内存占用低，适合大规模样本分析。
:material-target: 用途
基于标记基因的微生物组成和丰度定量
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * m):material-memory: 空间复杂度
O(m)相关工具¶
Kraken2 · mOTUs · HUMAnN
标签¶
[marker-gene](tags.md#marker-gene) [abundance](tags.md#abundance) [low-memory](tags.md#low-memory) [species-level](tags.md#species-level)