MetaPhlAn 4¶
2023年 宏基因组学 物种分类 进阶 (Intermediate)
MetaPhlAn 4
基于进化枝特异性标记基因的增强型物种定量工具,通过扩展标记基因数据库和改进比对策略提升分类灵敏度。 该方法在 MetaPhlAn 基础上新增了病毒和古菌标记基因支持,提供更全面的微生物群落组成分析能力。
:material-target: 用途
基于增强标记基因的微生物群落定量
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * m):material-memory: 空间复杂度
O(m):material-code: 实现语言
Python
相关工具¶
Kraken2 · mOTUs · Bracken
标签¶
[marker-gene](tags.md#marker-gene) [profiling](tags.md#profiling) [enhanced](tags.md#enhanced) [clade-specific](tags.md#clade-specific)