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methylKit

2012年 表观基因组学 甲基化分析 进阶 (Intermediate)

methylKit

高通量甲基化测序数据分析的 Bioconductor 工具包,支持甲基化位点注释、差异分析和功能区域聚合统计。 该方法兼容 RRBS 和 WGBS 数据设计,提供灵活的覆盖度过滤和滑动窗口分析功能,是比较不同条件下甲基化变化的常用工具。
:material-target: 用途
高通量甲基化测序数据的差异分析与功能注释
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * s)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)
:material-code: 实现语言
R

相关工具

Bismark · DSS · bsseq

标签

[methylation](tags.md#methylation) [bisulfite](tags.md#bisulfite) [differential](tags.md#differential) [bioconductor](tags.md#bioconductor)

:material-folder: 分类:表观基因组学 / 甲基化分析 | :material-identifier: ID:methylkit-bs