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MMseqs2

2017年 序列比对 双序列比对 进阶 (Intermediate)

MMseqs2

超快速序列搜索和聚类工具,利用多阶段搜索策略实现大规模序列数据库的高效比对和聚类。 该方法支持蛋白质和核苷酸序列的敏感搜索,适用于宏基因组学、蛋白质组学等大数据量分析场景。
:material-target: 用途
超快速序列搜索和聚类
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(mn)
:material-memory: 空间复杂度
O(m + n)
:material-code: 实现语言
C++

相关工具

BLAST · DIAMOND · Linclust

标签

[clustering](tags.md#clustering) [search](tags.md#search) [fast](tags.md#fast) [scalable](tags.md#scalable)

:material-folder: 分类:序列比对 / 双序列比对 | :material-identifier: ID:mmseqs2