跳转至

mOTUs

2017年 宏基因组学 物种分类 进阶 (Intermediate)

mOTUs

基于通用标记基因的微生物物种定量方法,利用核糖体蛋白基因的保守区域进行物种鉴定和丰度估计。 该方法不依赖完整参考基因组即可实现跨样品可比的物种水平定量,在海洋和肠道微生物组研究中被广泛采用。
:material-target: 用途
基于通用标记基因的微生物物种定量
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * m)
:material-memory: 空间复杂度
O(m)
:material-code: 实现语言
Python、C

相关工具

MetaPhlAn · Kraken2 · QIIME2

标签

[marker-gene](tags.md#marker-gene) [profiling](tags.md#profiling) [universal](tags.md#universal) [species-level](tags.md#species-level)

:material-folder: 分类:宏基因组学 / 物种分类 | :material-identifier: ID:motus