Octopus¶
2021年 变异检测 单核苷酸变异
Octopus
基于贝叶斯统计框架的单倍型感知变异检测工具,能够同时对生殖系和体细胞变异进行联合建模与推断。 该方法支持多样本联合分析,具有极高的变异检测灵敏度和特异性,适用于复杂基因组研究。
:material-target: 用途
贝叶斯单倍型感知的变异检测与联合推断
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * h):material-memory: 空间复杂度
O(h)相关工具¶
FreeBayes · GATK HaplotypeCaller · Strelka2
标签¶
[bayesian](tags.md#bayesian) [haplotype](tags.md#haplotype) [germline-somatic](tags.md#germline-somatic) [multi-sample](tags.md#multi-sample)