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Orione

2015年 数据压缩 专用压缩 进阶 (Intermediate)

Orione

利用参考辅助压缩的 FASTQ 和 SAM 格式压缩工具,将读段比对到参考序列后仅存储差异信息。该方法在有高质量参考基因组时压缩效果极佳。
:material-target: 用途
参考辅助的 FASTQ/SAM 压缩
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n)
:material-memory: 空间复杂度
O(1)
:material-code: 实现语言
C

相关工具

CRAM · Genozip · Spring

标签

[reference-assisted](tags.md#reference-assisted) [fastq](tags.md#fastq) [sam](tags.md#sam) [archival](tags.md#archival)

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