OrthoFinder¶
2019年 功能注释 同源性方法
OrthoFinder
面向多物种蛋白组比较的直系同源推断工具，可自动构建 orthogroup 并辅助功能转移与基因家族进化分析。 该方法在大规模比较基因组研究中广泛应用，适合将功能注释扩展到非模式物种和新组装基因组。
:material-target: 用途
基于直系同源群推断进行跨物种功能注释与基因家族分析
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n^2):material-memory: 空间复杂度
O(n^2)相关工具¶
eggNOG-mapper · BLAST+ · DIAMOND
标签¶
[orthology](tags.md#orthology) [comparative-genomics](tags.md#comparative-genomics) [gene-family](tags.md#gene-family) [annotation](tags.md#annotation)