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PanVC

2023年 图基因组学 变异图 高级 (Advanced)

PanVC

基于泛基因组图的变异检测流程,将比对、变异检测和分型步骤整合到图框架中。 该方法可减少参考基因组偏差,提高结构区域的变异检测准确性。
:material-target: 用途
基于泛基因组图的端到端变异检测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * m)
:material-memory: 空间复杂度
O(n)
:material-code: 实现语言
C++、Python

相关工具

VG · Minigraph · GATK

标签

[pangenome](tags.md#pangenome) [variant-calling](tags.md#variant-calling) [genotyping](tags.md#genotyping) [pipeline](tags.md#pipeline)

:material-folder: 分类:图基因组学 / 变异图 | :material-identifier: ID:panvc