跳转至

PCAdapt

2016年 群体遗传学 选择信号检测 进阶 (Intermediate)

PCAdapt

基于主成分分析的离群值检测方法,用于识别对群体结构有异常贡献的受选择位点。 该方法无需预先定义群体标签,可自动检测局部适应的遗传标记。
:material-target: 用途
基于 PCA 的选择信号和离群值检测
:material-clock-fast: 时间复杂度
O(n * m * k)
:material-memory: 空间复杂度
O(n * m)
:material-code: 实现语言
R、C++

相关工具

BayeScan · OutFLANK · Selscan

标签

[selection](tags.md#selection) [pca](tags.md#pca) [outlier-detection](tags.md#outlier-detection) [local-adaptation](tags.md#local-adaptation)

:material-folder: 分类:群体遗传学 / 选择信号检测 | :material-identifier: ID:pcadapt